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双叉犀金龟目前不是珍稀物种，但是其生存也面临一些威胁。

因为双叉犀金龟可作为宠物饲养，且制成标本有较高的收藏观赏价值，所以很多人在捕捉野生双叉犀金龟。而且双叉犀金龟成虫有趋光性，很容易被吸引到危险的人类居住区。在果园人们布下的防鸟网很容易就会将独角仙缠住造成大量死亡。

但是昆虫有繁殖速度快且产卵量多的特点，所以人为捕捉并不是威胁双叉犀金龟生存的主要原因。双叉犀金龟幼虫生长离不开森林下的腐殖质，所以对年代悠久的天然林非常依赖，在种植年代短的人工林中无法生存，所以对天然林的砍伐和破坏才是双叉犀金龟面临的最大威胁。